参考文献格式不对确实会影响查重结果，这一结论基于查重系统的识别机制与学术规范要求，具体影响机制及应对策略如下：

系统误判为正文内容
查重系统通过格式标签（如“参考文献”字样、编号、缩进等）识别文献部分。若格式不规范（如未单独成段、编号混乱、字体不符），系统可能将其视为正文，导致重复率计算包含参考文献内容。例如，知网系统若无法识别参考文献格式，会直接标红整段文献，使重复率虚高。

引用标注失效
正确引用需在文中标注作者、年份等信息，并在文末按规范列出文献。若格式错误（如漏写作者、年份，或引用编号与文献列表不匹配），系统可能无法识别引用关系，将引用内容判定为抄袭。

总字数统计偏差
规范格式下，查重系统通常排除目录、参考文献等非正文部分。若排版混乱，系统可能将这些部分计入总字数，导致重复率分母增大，间接影响结果准确性。

权威系统（如知网、维普、万方）
对格式要求严格，需完全符合其标准（如“参考文献”四字独占一行、英文文献格式统一）。若格式错误，重复率可能显著升高。

小众或免费系统
部分系统可能不支持参考文献识别，直接将其视为正文检测，导致重复率虚高。因此，优先使用学校指定的权威系统，避免因系统差异导致结果偏差。

可信度关联
参考文献格式规范程度反映论文学术水平。若格式松散，监考老师或审稿人可能对论文质量产生质疑，进而提高查重要求，形成“格式错误→查重更严”的恶性循环。

间接影响审核流程
即使查重系统不直接因格式扣分，导师或审稿人可能因格式问题要求返修，延迟论文审核。此外，不规范的格式可能留下不专业印象，影响学术声誉。

严格遵循学校格式要求
提前确认学校指定的格式标准（如字体、行距、编号方式），并确保目录、参考文献等部分完全符合规范。

使用引用管理工具
借助EndNote、Zotero等工具自动生成引用和参考文献列表，减少人为错误。例如，工具可确保中英文文献格式统一、编号连续。

提交前人工核查

优先选择权威查重系统
使用学校指定的系统（如知网）进行自查，避免因系统差异导致结果失真。若需降重，可结合智能工具（如AI降重系统）优化表达，但需保留核心观点和引用关系。

某学生论文内容均为原创，但因参考文献格式混乱（如未统一中英文格式、漏写作者年份），知网查重时系统无法识别文献部分，直接标红整段参考文献，导致重复率从15%飙升至30%。经格式修正后，重复率降至8%，符合学校要求。

参考文献格式错误是查重中的“隐形陷阱”，可能通过系统误判、引用失效、总字数偏差等机制直接影响结果，同时因学术规范要求间接影响审核流程。严格遵循格式标准、使用专业工具、选择权威系统，是避免此类问题的关键。